生物科技研究所於民國78年 3月奉教育部核准設立,為全國首創。本所以培育我國生物技術發展所需之基礎學術研究與專業技術人才為教育目標。目前僅設有碩士班,每年招收新生(含一般研究生、甄試生及在職生)10名。至今在本所完成碩士學的畢業生計有 330人,其中並有32位已在國內外大學獲得博士學位。生物科技研究所於100學年度開辦全英語碩士學位學程,共招收9名國際生,分別來自印度、印尼、泰國、馬來西亞、孟加拉及越南; 101學年度招收 6名國際生,分別來自印尼、美國及越南。102學年度招收 4名國際生;113學年度招收 2名國際生,分別來自奈及利亞及巴基斯坦。 本所教師除 5位專任教師擔任教學與研究外,並與理工學院的生命科學系及本院園藝暨生物技術學系,動物科學系、保健營養學系教師共同指導學位論文。研究領域涵蓋植物遺傳、植物生理、分子育種、遺傳工程、蛋白質工程、酵素技術、生物感測技術、動物生物技術及食品生物技術等基礎及應用研究。
歷屆主管
第1任所長為萬雄教授,自民國78年創所上任,至民國86年退休。第2任所長為蔡新教授,自民國86年上任至91年7月。第3任所長為黃士穎教授,自民國91年8月上任至96年7月。第4任所長為王淑音教授,自民國96年8月上任至113年1月。現任所長為林彥昌教授,自民國113年2月接任迄今。